Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms