Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms