Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP2C9P11712 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms