Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHGAP10645 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHGAP10645 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms