Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms