Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPBP07199 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPBP07199 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPBP07199 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPBP07199 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms