Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAVP06756 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms