Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms