Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms