Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms