Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms