Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNMO15061 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNMO15061 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNMO15061 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms