Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms