Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMNCA6NCL1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms