Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms