Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms