Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9Y3F1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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