Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms