Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms