Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRPC4Q9UBN4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms