Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFIP11Q9UBB9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms