Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRBP1Q9P2E9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms