Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHPF2Q9P2E5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287 ms