Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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HCN3Q9P1Z3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HCN3Q9P1Z3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HCN3Q9P1Z3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HCN3Q9P1Z3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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