Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms