Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO5CQ9NQX4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms