Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN4Q9NQP4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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