Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms