Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms