Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms