Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTA3Q9BTC8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms