Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NOTCH4Q99466 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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