Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALPK3Q96L96 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms