Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD3Q96L08 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms