Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms