Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A3Q93084 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms