Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms