Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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