Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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