Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC21AQ8NDW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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