Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTD1Q8N815 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms