Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIB1Q86YT6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIB1Q86YT6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms