Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC84Q86UT8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms