Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC1Q7Z7K0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms