Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms