Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRIG3Q6UXM1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms