Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms