Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms