Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms