Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms